L. fermentum CECT5716 có khả năng lên men nhiều loại carbohydrates tạo ra các acid béo chuỗi ngắn (SCFA) trong ruột, chúng là nguồn năng lượng quan trọng đối với tế bào đường ruột (Peran L et al. 2006). Các axit béo chuỗi ngắn làm tăng hấp thu nước và muối trong ruột, tham gia tích cực vào quá trình chuyển hóa tế bào biểu mô ruột kết và làm giảm độ pH, do đó hỗ trợ cho sự phát triển của vi sinh vật có lợi và ức chế sự phát triển của vi sinh vật gây bệnh. Hơn nữa, axit béo chuỗi ngắn axit propionic và axit acetic được vận chuyển đến các cơ quan khác như cơ bắp, não bộ và tim, nơi chúng đóng vai trò nguồn năng lượng.

L. fermentum CECT5716 kích thích các tế bào goblet tạo chất nhầy (glycoproteins) và nhờ đó bảo vệ biểu mô đường ruột khỏi rối loạn vật lý, hóa học và sinh học (Olivares M et al. 2006).

L. fermentum CECT5716 sản xuất ra glutathione, một chất chống oxy hóa tự nhiên, giúp bảo vệ đường ruột khỏi tổn hại do quả trình oxy hóa (Peran L et al. 2006).